Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Topbp1Q6ZQF0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms