Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift172Q6VH22 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms