Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casc1Q6TDU8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casc1Q6TDU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms