Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc57Q6PHN1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms