Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc85bQ6PDY0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc85bQ6PDY0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms