Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms