Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak1Q6PD31 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak1Q6PD31 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms