Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab2Q6PAM0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms