Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcd11Q6NS46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms