Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn11Q6J756 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms