Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ParpbpQ6IRT3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms