Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6GQU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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