Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp7Q6A4J8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Usp7Q6A4J8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Usp7Q6A4J8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp7Q6A4J8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp7Q6A4J8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp7Q6A4J8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp7Q6A4J8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp7Q6A4J8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp7Q6A4J8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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