Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Swap70Q6A028 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Swap70Q6A028 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms