Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn3Q69ZS0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms