Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms