Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrp4eQ66X19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms