Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp4Q62445 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sp4Q62445 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp4Q62445 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp4Q62445 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp4Q62445 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp4Q62445 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp4Q62445 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp4Q62445 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp4Q62445 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp4Q62445 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms