Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp2Q61990 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms