Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga7Q61738 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga7Q61738 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms