Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usf1Q61069 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usf1Q61069 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usf1Q61069 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usf1Q61069 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usf1Q61069 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usf1Q61069 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usf1Q61069 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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