Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn2cQ60772 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms