Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a3Q5XF89 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms