Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms