Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med13Q5SWW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms