Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp18Q5SSI6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms