Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zzef1Q5SSH7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms