Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1l2Q5SRX1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tom1l2Q5SRX1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tom1l2Q5SRX1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms