Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim41Q5NCC3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Trim41Q5NCC3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms