Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm12253Q5NC48 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm12253Q5NC48 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm12253Q5NC48 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm12253Q5NC48 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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