Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms