Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpjQ569L8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms