Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shank3Q4ACU6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms