Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brinp3Q499E0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brinp3Q499E0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms