Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d9Q3UYK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d9Q3UYK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms