Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc9Q3USL1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms