Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms