Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms