Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms