Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zswim8Q3UHH1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms