Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitpnm3Q3UHE1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms