Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrp36Q3UFY0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp36Q3UFY0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms