Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf3Q3UDR8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms