Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp6Q3U6U5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms