Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VwceQ3U515 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VwceQ3U515 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms