Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vars2Q3U2A8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms