Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd1Q3TXS7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms