Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxw18Q3TSA9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxw18Q3TSA9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms