Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna5Q2MKA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms