Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam178bQ24JP3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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